诸星博士之岛！化石宝可梦出现!!

前往下一个目的地琉璃市的途中，小智一行人来到了一座小岛。小胜在岛上看到“藤壶宝可梦”摇篮百合便追逐在后，因而与大家走散。大伙拼命寻找小胜，途中遇到了名叫诸星博士的男子。他正从事让古代宝可梦复活的研究，并说要让大家看看罕见的古虾宝可梦太古羽虫的进化。这时，火箭队的人又照惯例跑来作怪……