极巨化对战！最强王者丹帝！！小智与小豪，乘着洛奇亚出发！

从樱木博士那里听说角逐世界最强宝可梦训练家的大会“宝可梦世界锦标赛”，得到决赛门票的小智和小豪，为了能够第一时间见证这一刻，两人前往场馆所在地的伽勒尔地区。决赛双方是制霸关都地区四天王杯的阿渡和伽勒尔地区未尝败绩的超级明星丹帝。无败之男·丹帝的实力究竟如何？小智和皮卡丘跟大木博士一起了去在关都地区的枯叶市新设立的樱木研究所。在研究所，他们听说了传说的宝可梦出现在枯叶港的情报。小智他们为了跟它对战而前往港口，与此同时，一个来自枯叶市的叫做小豪的少年也确定了传说的宝可梦的身份，于是他也前往了港口……